Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DUOX1Q9NRD9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX1Q9NRD9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms