Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA4BQ9NPR2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA4BQ9NPR2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms