Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCDH12Q9NPG4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDH12Q9NPG4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms