Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
A4GALTQ9NPC4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
A4GALTQ9NPC4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms