Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CABP2Q9NPB3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CABP2Q9NPB3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms