Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBX8Q9HC52 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms