Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP29Q9HBJ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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