Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GFRA4Q9GZZ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms