Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXD1Q9GZZ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXD1Q9GZZ0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
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