Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR1EQ9GZS1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR1EQ9GZS1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms