Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SEMA4CQ9C0C4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms