Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM43Q9BTV4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM43Q9BTV4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms