Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRADC1Q9BSG0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRADC1Q9BSG0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms