Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM56Q9BRZ2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms