Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC39A3Q9BRY0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms