Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BPIFA3Q9BQP9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BPIFA3Q9BQP9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms