Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMIM7Q9BQ49 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMIM7Q9BQ49 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms