Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KC1Q96S38 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KC1Q96S38 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms