Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHIPQ96QV1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HHIPQ96QV1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms