Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACCSQ96QU6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms