Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB3IPQ96QF0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB3IPQ96QF0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms