Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CLUHP3Q96NS8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms