Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C8orf49Q96NF6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf49Q96NF6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms