Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
YTHDC1Q96MU7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
YTHDC1Q96MU7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms