Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NSMCE3Q96MG7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms