Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGD4Q96M96 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FGD4Q96M96 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms