Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CNBD2Q96M20 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CNBD2Q96M20 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms