Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
C9orf72Q96LT7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C9orf72Q96LT7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms