Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SENP8Q96LD8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SENP8Q96LD8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SENP8Q96LD8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms