Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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KCNS1Q96KK3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KCNS1Q96KK3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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