Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PGBD1Q96JS3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PGBD1Q96JS3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PGBD1Q96JS3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms