Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALML4Q96GE6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALML4Q96GE6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms