Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TVP23CQ96ET8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TVP23CQ96ET8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms