Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL38Q96DV4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL38Q96DV4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL38Q96DV4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL38Q96DV4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL38Q96DV4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL38Q96DV4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRPL38Q96DV4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL38Q96DV4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms