Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD4Q96DM1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms