Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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RNF183Q96D59 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF183Q96D59 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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