Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCC1Q96CN9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCC1Q96CN9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCC1Q96CN9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms