Protein–RNA interactions for Protein: Q96CD2

PPCDC, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCDCQ96CD2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPCDCQ96CD2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PPCDCQ96CD2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PPCDCQ96CD2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms