Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC127Q96BQ5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC127Q96BQ5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms