Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM3DQ96BQ1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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