Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NKD1Q969G9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NKD1Q969G9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms