Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZNF516Q92618 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF516Q92618 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms