Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DNAJA4Q8WW22 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms