Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SSH3Q8TE77 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSH3Q8TE77 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms