Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX54Q8TDD1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX54Q8TDD1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX54Q8TDD1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.8 ms