Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM35BQ8NCS4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms