Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF169Q8NCN4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF169Q8NCN4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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