Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPRYD3Q8NCJ5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRYD3Q8NCJ5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms