Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NHLRC2Q8NBF2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NHLRC2Q8NBF2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms