Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DNAAF3Q8N9W5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DNAAF3Q8N9W5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms